検索結果書誌詳細：蔵書検索システム

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蔵書情報

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所蔵数	1	在庫数	1	予約数	0

書誌情報サマリ

書名	ゲノム多様性解析
著者名	長田直樹／編著
著者名ヨミ	オサダナオキ
出版者	森北出版
出版年月	2025.3

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資料情報

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No.	所蔵館	配架場所	請求記号	資料番号	資料種別	状態	個人貸出	在庫
1	西部図書館	一般開架	4673/85/	1102778678	一般	在庫	可	○

書誌詳細

この資料の書誌詳細情報です。

タイトルコード	1000101238614
書誌種別	図書
書名	ゲノム多様性解析
書名ヨミ	ゲノムタヨウセイカイセキ
言語区分	日本語
著者名	長田直樹／編著　藤本明洋／著　河合洋介／著　五條堀淳／著　東野俊英／著　木村亮介／著　松波雅俊／著
著者名ヨミ	オサダナオキ　フジモトアキヒロ　カワイヨウスケ　ゴジョウボリジュン　ヒガシノトシヒデ　キムラリョウスケ　マツナミマサトシ
出版地	東京
出版者	森北出版
出版年月	2025.3
本体価格	￥４５００
ISBN	978-4-627-26171-6
ISBN	4-627-26171-6
数量	7,242p
大きさ	21cm
分類記号	467.3
件名	ゲノム　バイオインフォマティクス
注記	文献:章末
内容紹介	バイオインフォマティクス・進化遺伝学の知識をフォローしつつ、「ゲノム多様性解析」を基礎から丁寧に解説。サンプルゲノムデータとソフトウェアによる、様々な解析の実践法も取り上げる。
著者紹介	東京大学大学院理学系研究科博士課程修了。北海道大学大学院情報科学研究院准教授。博士(理学)。
目次タイトル	1.はじめに
	1.1 ゲノム多様性解析とは　1.2 本書で用いるデータセット　参考文献
	2.シークエンスデータとクオリティチェック
	2.1 シークエンスデータとは　2.2 シークエンスデータの操作　参考文献
	3.多型の検出
	3.1 多型とは　3.2 データのフォーマット　3.3 シークエンスデータ解析　参考文献
	4.ハプロタイプ解析
	4.1 ハプロタイプとゲノム多様性　4.2 Beagleによるフェージング　参考文献
	5.表現型の解析
	5.1 表現型の特性と解析　5.2 ヒトの表現型のGWAS　参考文献
	6.集団の多様性解析
	6.1 多様性を記述する　6.2 多様性の記述からわかること　6.3 VCFtools/bcftoolsによる各種要約統計量の算出　参考文献
	7.集団構造の可視化
	7.1 集団構造を可視化する方法　7.2 遺伝距離を用いた階層的クラスタリング　7.3 遺伝モデルベースのクラスタリング解析　7.4 多変量解析　7.5 解析結果を解釈するうえでの注意点　7.6 ゲノムデータを用いた集団構造の可視化　参考文献
	8.集団サイズの推定
	8.1 集団サイズとゲノム多様性　8.2 集団サイズの推定　参考文献
	9.集団の分岐・混合
	9.1 集団とは　9.2 アレル頻度の時間による変化　9.3 集団の混合　9.4 アレル頻度を用いた多集団解析　参考文献
	10.正の自然選択の検出
	10.1 正の自然選択と遺伝的多様性　10.2 アウトライヤーアプローチと検定アプローチ　10.3 統計量を用いた正の自然選択の検出　10.4 VCFtools/selscanを用いた正の自然選択の検出　参考文献
	11.ターゲットシークエンシング
	11.1 ターゲットシークエンシングの原理と手法　11.2 StacksによるRAD‐seq解析　参考文献
	12.分岐年代の推定
	12.1 分岐年代の推定とは　12.2 集団の分岐年代推定はなぜ難しいのか　12.3 分岐年代推定に必要なデータ　12.4 分岐年代推定の方法　参考文献
	A.解析環境の構築
	A.1 Windowsでの環境構築　A.2 Condaを用いた解析環境の構築　A.3 Condaを用いた仮想環境の切り替え　A.4 Dockerによる解析環境の利用
	B.各種ソフトウェアのインストール
	C.UN*Xコマンド