蔵書情報
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書誌情報サマリ
| 書名 |
分子進化と分子系統学
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| 著者名 |
根井 正利／共著
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| 著者名ヨミ |
ネイ マサトシ |
| 出版者 |
培風館
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| 出版年月 |
2006.7 |
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資料情報
各蔵書資料に関する詳細情報です。
| No. |
所蔵館 |
配架場所 |
請求記号 |
資料番号 |
資料種別 |
状態 |
個人貸出 |
在庫
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| 1 |
西部図書館 | 一般開架 | 4675/54/ | 1102015375 | 一般 | 在庫 | 可 |
○ |
書誌詳細
この資料の書誌詳細情報です。
| タイトルコード |
1000000162385 |
| 書誌種別 |
図書 |
| 書名 |
分子進化と分子系統学 |
| 書名ヨミ |
ブンシ シンカ ト ブンシ ケイトウガク |
| 言語区分 |
日本語 |
| 著者名 |
根井 正利／共著
S.クマー／共著
根井 正利／監訳・改訂
大田 竜也／共訳
竹崎 直子／共訳
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| 著者名ヨミ |
ネイ マサトシ S クマー ネイ マサトシ オオタ タツヤ タケザキ ナオコ |
| 著者名原綴 |
Kumar Sudhir |
| 出版地 |
東京 |
| 出版者 |
培風館
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| 出版年月 |
2006.7 |
| 本体価格 |
￥７０００ |
| ISBN |
4-563-07801-8 |
| 数量 |
11,410p |
| 大きさ |
22cm |
| 分類記号 |
467.5
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| 件名 |
分子進化
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| 注記 |
原タイトル:Molecular evolution and phylogenetics |
| 注記 |
文献:p358～388 |
| 内容紹介 |
分子進化研究に役立つ統計的なデータ解析手法を、近年新たに開発されたものも含めて紹介し、実際の解析の中でどう使いこなすかを説明する。分子進化研究にかかわる学生、研究者必携の書。 |
内容細目
| No. |
内容タイトル |
内容著者１ |
内容著者２ |
内容著者３ |
内容著者４ |
| 1 |
第1章 進化の分子生物学的基礎 |
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1.1 生命の進化系統樹 |
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1.2 進化の機構 |
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1.3 遺伝子の構造と機能 |
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1.4 DNA配列の変化と突然変異 |
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| 6 |
1.5 コドンとその使用頻度 |
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| 7 |
第2章 アミノ酸配列の進化的変化 |
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| 8 |
2.1 アミノ酸の違いとアミノ酸の異なるサイトの割合 |
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| 9 |
2.2 ポアソン補正(PC)距離とガンマ補正距離 |
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| 10 |
2.3 ブートストラップ分散と共分散 |
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| 11 |
2.4 アミノ酸置換行列 |
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| 12 |
2.5 突然変異率と遺伝子の置換速度 |
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| 13 |
第3章 塩基配列の進化的変化 |
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| 14 |
3.1 塩基配列間の違い |
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| 15 |
3.2 塩基置換数の推定 |
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| 16 |
3.3 ガンマ補正距離 |
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| 17 |
3.4 進化距離の推定 |
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| 18 |
3.5 塩基配列のアラインメント |
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| 19 |
3.6 進化距離を推定する場合の配列ギャップの扱い方 |
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| 20 |
第4章 同義および非同義塩基置換数 |
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| 21 |
4.1 進化経路法 |
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| 22 |
4.2 Kimuraのモデルに基づいた方法 |
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| 23 |
4.3 コドンの第一,第二および第三ポジションでの塩基置換 |
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| 24 |
4.4 最尤法による推定 |
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| 25 |
第5章 系統樹 |
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| 26 |
5.1 系統樹の種類 |
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| 27 |
5.2 樹形の違い |
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| 28 |
5.3 系統樹作成法 |
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| 29 |
5.4 系統樹作成法に関する論争 |
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| 30 |
第6章 系統樹の推定:距離法 |
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| 31 |
6.1 UPGMA |
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| 32 |
6.2 最小二乗(LS:least squares)法 |
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| 33 |
6.3 最小進化(ME:minimum evolution)法 |
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| 34 |
6.4 近隣結合(NJ:neighbor‐joining)法 |
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| 35 |
6.5 系統樹作成に適当な進化距離 |
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| 36 |
第7章 系統樹の推定:最節約法 |
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7.1 最節約(MP)系統樹の作成原理 |
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| 38 |
7.2 MP系統樹の検索方法 |
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| 39 |
7.3 コンセンサス系統樹 |
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| 40 |
7.4 枝長の推定 |
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| 41 |
7.5 加重節約法 |
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| 42 |
7.6 アミノ酸配列を用いたMP法 |
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| 43 |
7.7 共有派生形質 |
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| 44 |
第8章 系統樹の推定:最尤法 |
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| 45 |
8.1 ML法の計算手続き |
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| 46 |
8.2 塩基置換モデル |
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| 47 |
8.3 タンパクデータを用いた最尤法 |
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| 48 |
8.4 最尤法の理論的基礎 |
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| 49 |
8.5 特定の樹形でのパラメーター推定 |
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| 50 |
8.6 ベイズ法による系統樹作成 |
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| 51 |
第9章 系統樹の精度と統計的検定 |
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| 52 |
9.1 最適化原理と樹形の誤り |
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| 53 |
9.2 内部枝検定 |
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| 54 |
9.3 ブートストラップ検定 |
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| 55 |
9.4 樹形の違いの検定 |
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| 56 |
9.5 様々な系統樹作成法の長所と短所 |
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| 57 |
第10章 分子時計と線形化系統樹 |
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| 58 |
10.1 分子時計仮説 |
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| 59 |
10.2 相対速度検定 |
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| 60 |
10.3 系統樹を用いた検定 |
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| 61 |
10.4 線形化系統樹 |
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| 62 |
10.5 分子時計が成り立たない揚合の進化時間の推定 |
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| 63 |
第11章 祖先タンパクのアミノ酸配列と自然選択 |
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| 64 |
11.1 祖先配列の推測:節約法 |
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| 65 |
11.2 祖先配列の推測:ベイズ法 |
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| 66 |
11.3 祖先の枝で生じた同義置換数と非同義置換数 |
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| 67 |
11.4 各コドン・サイトにおける自然選択 |
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| 68 |
11.5 収斂進化と平行進化 |
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| 69 |
第12章 遺伝的多型と進化 |
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| 70 |
12.1 遺伝的多型の進化的意義 |
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| 71 |
12.2 遺伝子頻度データの解析 |
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| 72 |
12.3 分集団における遺伝的多様性 |
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| 73 |
12.4 多くの遺伝子座での遺伝的変異 |
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| 74 |
12.5 DNA多型 |
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| 75 |
12.6 自然選択を検出するための統計的方法 |
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| 76 |
第13章 遺伝的マーカーによる集団系統樹 |
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| 77 |
13.1 遺伝子頻度データのための遺伝距離 |
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| 78 |
13.2 制限酵素による塩基配列の解析 |
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| 79 |
13.3 RAPDデータの解折 |
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| 80 |
第14章 将来への展望 |
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| 81 |
14.1 統計的方法 |
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| 82 |
14.2 ゲノム計画 |
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| 83 |
14.3 分子生物学と進化 |
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| 84 |
付録 |
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| 85 |
A 数学記号と数学表記 |
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| 86 |
B 地質年代 |
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| 87 |
C 新生代と中生代の地質学的できごと |
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| 88 |
D 化石データに基づく生物進化上のできごと |
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